Badan Eksekutif Mahasiswa yang selanjutnya disingkat BEM dibentuk pada MUBES V LM Tahun 1999. sebagai pemimpin BEM pertama adalah sdr Sarino sekaligus sebagai masa perintisanBEM, disinilah nama AMIKOM mulai terdengar gaungnya dimana-mana. BEM telah eksis selama 5 periode (1999-2004). Namun dalam perjalanan kepengurusan BEM ditahun-tahun berikutnya mulai terjadi kefakuman kepengurusan disana-sini sehingga pada 2004 lahirlah sidang istimewa II LM
Dalam MUBES istimewa LM tahun 2004 ini BEM ditiadakan dan digabungkan kedalam SEMA, sehingga SEMA memiliki fungsi ganda, sebagai lembaga legislatif dan kesekutif mahasiswa. namun dalam perjalanan kepengurusan tersebut ternyata BEM dianggap penting dan dibutuhkan keberadaannnya. sehingga pada tahun 2006 sesuai MUBES LM kemudian BEM mulai difungsikan lagi keberadaannnya. ditahun 2006 terpilih sebagai presiden mahasiswa sdr Wahyu Giyatmoko dan sebagai wakil presiden sdr Muhammad Muizzuddin Yanuar dalam Pemilwa tanggal 18 Desember 2006. pada masa kepengurusan dengan paradigma baru ini mulai memperbarui diri dan bangkit kembali fungsi dan perannya sebagai organisasi mahasiswa pengemban amanat MUBES dan pemegang kekeuasaan ekesekutif di lembaga Mahasiswa STMIK AMIKOM yogyakarta hingga sekarang.
VISI
Meningkatkan solidaritas dan menumbuhkembangkan kerja sama yang saling mendukung antara mahasiswa dan orma untuk mendukung terwujudnya visi Amikom yakni menjadi Penguruan Tinggi Komputer Terbaik di Asia ASEAN.
MISI
1. Mengangkat image BEM diantara organisasi mahasiswa dan mahasiswa.
2. Melakukan kegiatan kreatif untuk organisasi mahasiswa dan mahasiswa sesuai minat dan bakat yang dimiliki.
3. Melakukan pembinaan yang bersinergi dan berkesinambungan terhadap Badan Semi Otonom.
4. Meningkatkan ilmu dan kemampuan anggota BEM sesuai dengan perkembangan ilmu pengetahuan dan tekhnologi.
5. Membangun komunikasi dan kerjasama yang efektif antar mahasiswa.
Dalam MUBES istimewa LM tahun 2004 ini BEM ditiadakan dan digabungkan kedalam SEMA, sehingga SEMA memiliki fungsi ganda, sebagai lembaga legislatif dan kesekutif mahasiswa. namun dalam perjalanan kepengurusan tersebut ternyata BEM dianggap penting dan dibutuhkan keberadaannnya. sehingga pada tahun 2006 sesuai MUBES LM kemudian BEM mulai difungsikan lagi keberadaannnya. ditahun 2006 terpilih sebagai presiden mahasiswa sdr Wahyu Giyatmoko dan sebagai wakil presiden sdr Muhammad Muizzuddin Yanuar dalam Pemilwa tanggal 18 Desember 2006. pada masa kepengurusan dengan paradigma baru ini mulai memperbarui diri dan bangkit kembali fungsi dan perannya sebagai organisasi mahasiswa pengemban amanat MUBES dan pemegang kekeuasaan ekesekutif di lembaga Mahasiswa STMIK AMIKOM yogyakarta hingga sekarang.
VISI
Meningkatkan solidaritas dan menumbuhkembangkan kerja sama yang saling mendukung antara mahasiswa dan orma untuk mendukung terwujudnya visi Amikom yakni menjadi Penguruan Tinggi Komputer Terbaik di Asia ASEAN.
MISI
1. Mengangkat image BEM diantara organisasi mahasiswa dan mahasiswa.
2. Melakukan kegiatan kreatif untuk organisasi mahasiswa dan mahasiswa sesuai minat dan bakat yang dimiliki.
3. Melakukan pembinaan yang bersinergi dan berkesinambungan terhadap Badan Semi Otonom.
4. Meningkatkan ilmu dan kemampuan anggota BEM sesuai dengan perkembangan ilmu pengetahuan dan tekhnologi.
5. Membangun komunikasi dan kerjasama yang efektif antar mahasiswa.
